Strategi adalah rumusan umum untuk mencapai sasaran secara spesifik yang dijabarkan ke masing-masing kebijakan berdasarkan analisis SWOT, Streng (Kekuatan), Weakness (Kelemahan), Opurtunities (Peluang), Threat (tantangan). Berbagai kebijakan di tiap-tiap strategi diterjemahkan ke dalam program dan kegiatan.
Berdasarkan SWOT dalam kertas kerja maka strategi yang ditempuh selama lima tahun, meliputi:
- Penataan kebijakan dan sistem pengawasan berbasis risiko
- Peningkatan kualitas pelaksanaan pemeriksaan
- Peningkatan kompetensi aparat pengawas intern pemerintah